| |
|
|
| Registros recuperados : 77 | |
| 4. |  | MENDONCA, C. L.; KOHAYAGAWA, A.; SCHENK, M. A. M.; MADRUGA, C. R. AFONSO, J. A. B. Avaliacao clinica e hematologica de bezerros nelores infectados experimentalmente com isolados de Babesia bigemina das regioes Sudeste, Nordeste e Norte do Brasil. In: SEMINARIO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA, 11., SEMINARIO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA DOS PAISES DO MERCOSUL, 2; SIMPOSIO DE CONTROLE INTEGRADO DE PARASITOS DE BOVINOS, 1., 1999, Salvador. Anais... Ilheus: Colegio Brasileiro de Parasitolgia Veterinaria, [1999?]. p.202. CNPGC. Resumo TL-PB-346.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
|   |
| 6. | | MENDONCA, C. L.; KOHAYAGAWA, A.; SCHENK, M. A. M.; MADRUGA, C. R.; AFONSO, J. A. B. Avaliacao da medula ossea em bezerros nelores infectados experimentalmente com isolados de Babesia bigemina das regios Sudoeste, Nordeste e Norte do Brasil. In: SEMINARIO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA, 11., SEMINARIO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA DOS PAISES DO MERCOSUL, 2; SIMPOSIO DE CONTROLE INTEGRADO DE PARASITOS DE BOVINOS, 1., 1999, Salvador. Anais... Ilheus: Colegio Brasileiro de Parasitolgia Veterinaria, [1999?]. p.202. CNPGC. Resumos TL-PB-347.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 9. | | ADRIÃO, M. G. F.; JIMÉNEZ, G. C.; MARIS, A. B.; WISCHRAL, A.; AFONSO, J. B. Variaciones circadianas de los niveles de P, CA++, y sericos y orinarios de NA+, K+, ureia y creatinina en los caprinos bajo ingestión de sipaúba (Thiloa glaucocarpa). In: CONGRESSO IBEROAMERICANO DE RAZAS CRIOLLAS Y AUTOCTONAS, 6.; SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACION Y UTILIZACION DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 4., 2003, Recife. [S.l.]: Federación Iberoamericana de Razas Criollas: CYTED, 2003. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 10. | | MIRANDA NETO, E. G.; AFONSO, J. A. B.; MENDONÇA, C. L.; ALMEIDA, M. Z. P. R. B. Avaliação do comportamento clínico e das características do suco ruminal em caprinos com acidose láctica induzida experimentalmente. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE BUIATRIA, 11.; CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 5.; CONGRESSO NORDESTINO DE BUIATRIA, 3., 2003, Salvador. Sanidade, base da economia pecuária: programa final: livro de resumos. Salvador: Associação Brasileira de Buiatria, 2003. p. 37. ref. 076.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 11. | | SANTOS, R. A.; CAMPOS, A. G. S. S.; AFONSO, J. A. B.; SOARES, P. C.; MENDONÇA, C. L. de. Efeito da administração de propileno glicol e cobalto associado à vitamina B12 sobre o perfil metabólico e a atividade enzimática de ovelhas da raça Santa Inês no periparto. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 32, Supl. 1, p. 60-66, dez. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 12. | | SILVA, A. A. da; ADRIÃO, M.; JIMENEZ, G. C.; SANTOS, M. C. da R.; WISCHRAL, A.; AFONSO, J. A. B. Estudo do polimorfismo genético da alpha S1-caseína em cabras, no Estado de Pernambuco, Brasil. Acta Scientiarum. Animal Sciences Maringá, v. 29, n. 3, p. 255-259, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 14. | | ALMEIDA, M. Z. P. R. B. de; MENDONÇA, C. L. de; AFONSO, J. A. B.; MIRANDA NETO, E. G. de. Estudo clínico, hematológico e bioquímico em caprinos submetidos à acidose láctica ruminal induzida experimentlamente. Veterinária e Zootecnia, Botucatu, v. 15, n. 1, p. 100-113, abr. 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 15. | | VIEIRA, A. C. S.; AFONSO, J. A. B.; MENDONÇA, C. L.; COSTA, N. A.; SOUZA, M. I. Estudo retropectivo da acidose láctica em caprinos e ovinos atendidos na Clínica de Bovinos, Campus Garanhuns/UFRPE. Revista Brasileira de Ciência Agrárias, v. 1, n. 1, p. 97-101, out./dez. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|  |
| 16. | | VIEIRA, A. C. S.; AFONSO, J. A. B.; MENDONÇA, C. L.; COSTA, N. A.; SOUZA, M. I. Estudo retrospectivo da acidose láctea em caprinos e ovinos atendidos na Clínica de Bovinos, Campus Garanhuns/UFRPE. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, Recife, v. 1, p. 97-101, out./dez. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 17. | | VIEIRA, A. C. S.; AFONSO, J. A. B.; MENDONÇA, C. L.; COSTA, N. A.; SOUZA, M. I. Estudo retrospectivo da acidose láctica em caprinos e ovinos atendidos na Clínica de Bovinos, Campus Garanhuns/UFRPE. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, Recife, v. 1, p. 97-101, out./dez. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Semiárido. |
| |
| 18. | | VIEIRA, A. C. S.; AFONSO, J. A. B.; MENDONÇA, C. L.; COSTA, N. A.; SOUZA, M. I. Estudo retrospectivo da acidose láctica em caprinos e ovinos atendidos na Clínica de Bovinos, Campus Garanhuns/UFRPE. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, v.2, n.2, p.161-167, abr./jun., 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 19. | | MIRANDA NETO, E. G. de; AFONSO, J. A. B.; SILVA, S. de T. G. da; MENDONÇA, C. L. Utilização da monensina sódica na prevenção da acidose láctica ruminal induzida em caprinos: resultados preliminares. Ciência Animal Brasileira, v. 10, n. 3, p. 128-133, 2009. Suplemento 1. Edição das palestras e resumos de trabalho apresentados durante o VIII CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, realizado em Belo Horizonte, outubro de 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 20. | | OLIVEIRA, K. S. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; MELO, A. L. de; REGITANO, L. C. de A. Variantes da região promotora do gene KCNJ11 em bovinos da raça Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 26. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| Registros recuperados : 77 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
16/08/2021 |
|
Data da última atualização: |
17/08/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UFSCAR; MARCELA MARIA DE SOUZA, IOWA STATE UNIVERSITY; KARINA SANTOS DE OLIVEIRA, UFSCAR; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UFSCAR; JULIANA AFONSO, ESALQ/USP; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
Muscle allele-specific expression QTLs may affect meat quality traits in Bos indicus. |
|
Ano de publicação: |
2021 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 11, p. 1-14, 2021. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-021-86782-2 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Article number: 7321. |
|
Conteúdo: |
Abstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specific expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specific expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were overlapped with methylation data from reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) obtained from 12 animals of the same population. We identified 1134 aseQTLs associated with 126 different ASE SNPs. For 215 aseQTLs, one allele potentially affected the affinity of a muscle-expressed transcription factor to its binding site. 162 aseQTLs were predicted to affect 149 miRNA binding sites, from which 114 miRNAs were expressed in muscle. Also, 16 aseQTLs were methylated in our population. Integration of aseQTL with GWAS data revealed enrichment for traits such as meat tenderness, ribeye area, and intramuscular fat . To our knowledge, this is the first report of aseQTLs identification in bovine muscle. Our findings indicate that various cis-regulatory and epigenetic mechanisms can affect multiple variants to modulate the allelic expression. Some of the potential regulatory variants described here were associated with the expression pattern of genes related to interesting phenotypes for livestock. Thus, these variants might be useful for the comprehension of the genetic control of these phenotypes. MenosAbstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specific expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specific expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were overlapped with methylation data from reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) obtained from 12 animals of the same population. We identified 1134 aseQTLs associated with 126 different ASE SNPs. For 215 aseQTLs, one allele potentially affected the affinity of a muscle-expressed transcription factor to its binding site. 162 aseQTLs were predicted to affect 149 miRNA binding sites, from which 114 miRNAs were expressed in muscle. Also, 16 aseQTLs were methylated in our population. Integration of aseQTL with GWAS data revealed enrichment for traits such as meat tenderness, ribeye area, and intramuscular fat . To our knowledge, this is the first report of aseQTLs identification in bovine muscle. Our findings indicate that var... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Allele-specific expression; Allelic expression; Expressão alélica; Imprint genômico; Loci de característica quantitativa; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
|
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado Nelore. |
|
Thesaurus NAL: |
Genomic imprinting; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225232/1/MuscleAlleleSpecific.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03076naa a2200385 a 4500
001 2133623
005 2021-08-17
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-021-86782-2$2DOI
100 1 $aBRUSCADIN, J. J.
245 $aMuscle allele-specific expression QTLs may affect meat quality traits in Bos indicus.$h[electronic resource]
260 $c2021
500 $aArticle number: 7321.
520 $aAbstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specific expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specific expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were overlapped with methylation data from reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) obtained from 12 animals of the same population. We identified 1134 aseQTLs associated with 126 different ASE SNPs. For 215 aseQTLs, one allele potentially affected the affinity of a muscle-expressed transcription factor to its binding site. 162 aseQTLs were predicted to affect 149 miRNA binding sites, from which 114 miRNAs were expressed in muscle. Also, 16 aseQTLs were methylated in our population. Integration of aseQTL with GWAS data revealed enrichment for traits such as meat tenderness, ribeye area, and intramuscular fat . To our knowledge, this is the first report of aseQTLs identification in bovine muscle. Our findings indicate that various cis-regulatory and epigenetic mechanisms can affect multiple variants to modulate the allelic expression. Some of the potential regulatory variants described here were associated with the expression pattern of genes related to interesting phenotypes for livestock. Thus, these variants might be useful for the comprehension of the genetic control of these phenotypes.
650 $aGenomic imprinting
650 $aQuantitative trait loci
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aBos Indicus
650 $aGado Nelore
653 $aAllele-specific expression
653 $aAllelic expression
653 $aExpressão alélica
653 $aImprint genômico
653 $aLoci de característica quantitativa
653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único
700 1 $aSOUZA, M. M. de
700 1 $aOLIVEIRA, K. S. de
700 1 $aROCHA, M. I. P.
700 1 $aAFONSO, J.
700 1 $aCARDOSO, T. F.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aNICIURA, S. C. M.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tScientific Reports$gv. 11, p. 1-14, 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
